|
Андрей
Чернов. Заметки о вечном БАЗОВАЯ МОДЕЛЬ тРНК И СЕРЕБРЯНОЕ СЕЧЕНИЕ Летом
• Базовая модель тРНК (пропорциональный анализ на основе
публикации О. О. Фаворовой) СПРАВКА: Нуклеиновые кислоты –
основа живой материи. Молекулы нуклеиновых кислот ДНК и РНК хранят в себе
генетическую информацию, необходимую для жизни и размножения клетки. Транспортная РНК доставляет аминокислоты к рибосоме[1]. Академик и директор Института белка РАН А. С. Спирин
полагает, что с биологического мира РНК на Земле началась жизнь. Сделаем
выписку из его работы: «По ряду
соображений именно РНК, а не ДНК, могла представлять собой первичный
генетический материал. Во-первых, и в химическом синтезе, и в
биохимических реакциях рибонуклеотиды предшествуют дезоксирибонуклеотидам;
дезоксирибонуклеотиды – продукты модификации рибонуклеотидов. Во-вторых, в
самых древних, универсальных процессах жизненного метаболизма широко
представлены именно рибонуклеотиды, а не дезоксирибонуклеотиды, включая
основные энергетические носители типа рибонуклеозид-полифосфатов. В-третьих,
репликация РНК может происходить без какого бы то ни было участия ДНК, а
механизм редупликации ДНК даже в современном живом мире требует обязательного
участия РНК-затравки в инициации синтеза цепи ДНК. В-четвертых, обладая
всеми теми же матричными и генетическими функциями, что и ДНК, РНК способна
также к выполнению ряда функций, присущих белкам, включая катализ химических
реакций. Таким образом, имеются все основания рассматривать ДНК как более
позднее эволюционное приобретение – как модификацию РНК, специализированную
для выполнения функции воспроизведения и хранения уникальных копий генов в
составе клеточного генома без непосредственного участия в биосинтезе белков»[2]. Базовая молекула тРНК состоит из 76 нуклеотидов четырех основных типов (аденин, гуанин, цитозин, и урацил) и нескольких их модификаций. Основной функциональный элемент тРНК называется антикодоном (№№ 34–36). Он узнает кодон ДНК и определяет соответствующую ему аминокислоту. Вспомним, что средний радиус Земли относится к толщине земной мантии по √5. Вот и С. А. Родионова обнаружила, что по √5 начало антикодона связано с длиной тРНК: 76 : 34 = 2,235... → √5 =
2,236... И из этого следует, что отрезки, на которые № 34 делит молекулу, относятся друг к другу по пропорции двойного минорного золота: 76 – 34 = 42 42 : 34
= 1,235... → √5 – 1 И еще Родионова установила, что золотое сечение приходится на 47-й нуклеотид, уникальный элемент тРНК, после которого в петле базовой молекулы возможно появление цепочки дополнительных нуклеотидов: 76 : 47 = 1,617... В обоих случаях мы имеем дело с идеальным для целочисленных отношений приближением к золотым числам (отклонение лишь 1/1000). ЗАМЕТКИ НА ПОЛЯХ Отношение точек 47 и 34 близко к √2, но это
следствие того, что две главнейших структурных точки[3] молекулы
(47 и 34) оказались связаны с длиной тРНК золотыми отношениями. Реально же √2
проявляется в другой пропорции: 54 из 76 элементов базовой тРНК являются
неконсервативными (то есть различными у разных модификаций этой молекулы): 76 : 54 ≈ 1,41... → √2 Основу структуры базовой тРНК составляют первые и
последние в ветвях парные (соединенные водородными связями) элементы (1 – 72,
7 – 66, 10–25 и т. д.). К структурным точкам надо отнести 17 и 20 нуклеотиды,
(после них может происходить добавление 1–2 дополнительных нуклеотидов), 34
(начало антикодона), 47 (после него может добавляться до 16 нуклеотидов) и 74
(начало акцепторного стебля – хвоста молекулы), 35 и 57 (вершины III и IV ветвей,
связанные между собой пропорцией числа Ф),
и, наконец, – 76. В базовой тРНК множитель (или делитель) √5 – 1
из 24 структурных точек объединяет 17[4]:
10-13-17-22-27-34-43; 25-31-39-49; 52-65; 76-62; 47-39; 20-17[5]. Десять структурных точек связаны делителем 2√2.
(Напомним, что так связан радиус земли и толщина внешнего ядра.) Это 76-27;
62-22; 47-17; 31-13; 27-10. Поскольку нас интересует связь золотой пропорции с
числом π, определим точку диаметра от целого и зеркальную
ей: 76 : π = 24,2 →
25 (точка перегиба, последний
парный элемент верха II ветви) 76 – 25 = 52
(точка перегиба, последний парный элемент верха IV ветви) Эти точки нам уже знакомы, по множителю √5 – 1
они входили в пары 25-31 и 52-65. Кроме того,
52/20 и 65/25 (как 17/7, 43/17 и 34/13) мотивированы приближением к
Ф2.
А вот от точки 10 (первая во II ветви)
до 35 (центр антикодона, вершина III ветви), также как от 22 до 47,
– ровно диаметр. Пропорцию,
равную отношению целого к диаметру от целого, мы назовали серебряным сечением[6]. Золотое и серебряное сечение связаны отношением
сторон прямоугольника антропоморфного (живого
ростового) квадрата: 1,03 к 1. Живой квадрат – архитектурный термин. В
данном случае речь идет о диаметре двойного мажорного золота (Ga): Ga = (√5 + 1) : π = 1,03... 76 : Ga = 73,8 →
74 (начало «стебля» молекулы)[7] Пропорция живого квадрата – это коэффициент, на
который надо умножить π/2, чтобы
получить число Ф. Выражение π/2 нередко встречается, к примеру, в кристаллографии.
В тРНК оно связывает несколько пар структурных точек: 10/7; 17/27; 31/20 и
31/49; 34/22 и 52/34; 39/62 и 39/25; 47/74; 66/43; 73/47. При этом
значение π/2 = 1,57 близко к золотому числу Ф = 1,62 и потому выходит, что 10/7;
31/20; 34/22; 39/25 объединены двойной связью. Итак, большинство структурообразующих точек базовой тРНК расположены по гармоническим константам. Из числа структурных можно выделить особые сакральные точки, соединенные как минимум с двумя другими структурными не только по иррациональным константам (√5, √2, золотому сечению), но и по трансцендентному числу π. Сакральные
точки – некие гармонические узлы, места пропорциональной увязки
разноприродных констант. Таковы, скажем, точка диаметра (25) и зеркальная ей
точка «минус диаметра» (52), связанные золотом (дважды) и, кроме того,
трансцендентным числом π
(также дважды). |
